Quando si aggiunge un nuovo dominio trastato ad Active Directory è necessario configurare la People Picker di SharePoint per configurare i domini su cui deve cercare gli utenti/gruppi.
Tramite questo script PowerShell è possibile impostare il dominio attuale ed uno o più domini di ricerca:
$wa = Get-SPWebApplication http://my-webapp.sgart.local/

#$wa.PeoplePickerSettings.SearchActiveDirectoryDomains.clear()  # se si vuole cancellare il contenuto precedente

$adsearchobj = New-Object Microsoft.SharePoint.Administration.SPPeoplePickerSearchActiveDirectoryDomain
$adsearchobj.DomainName = "sgart.local"  # dominio attuale
$wa.PeoplePickerSettings.SearchActiveDirectoryDomains.Add($adsearchobj)

$adsearchobj = New-Object Microsoft.SharePoint.Administration.SPPeoplePickerSearchActiveDirectoryDomain
$adsearchobj.DomainName = "sgart.new"  # nuovo dominio trastato "two way"
$wa.PeoplePickerSettings.SearchActiveDirectoryDomains.Add($adsearchobj)

$wa.Update()
Va fatto su tutte le web application interessate compresa la central administration.
Lo script non crea disservizio.